Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SCAPERQ9BY12 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SCAPERQ9BY12 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SCAPERQ9BY12 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms