Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDCA4Q9BXL8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms