Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC3Q9BQ90 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHDC3Q9BQ90 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms