Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRRX2Q99811 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRRX2Q99811 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRRX2Q99811 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms