Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
YME1L1Q96TA2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YME1L1Q96TA2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms