Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ALS2Q96Q42 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ALS2Q96Q42 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALS2Q96Q42 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms