Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ5

CMTM7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM7Q96FZ5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CMTM7Q96FZ5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM7Q96FZ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms