Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAF2Q96CS3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAF2Q96CS3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms