Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
GCC1Q96CN9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GCC1Q96CN9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GCC1Q96CN9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms