Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN23Q96B33 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN23Q96B33 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN23Q96B33 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms