Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM3CQ92520 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM3CQ92520 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM3CQ92520 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms