Protein–RNA interactions for Protein: Q92393

TY1B-OR, Transposon Ty1-OR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ORQ92393 GTT1YIR038C 705 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 PDR15YDR406W 4590 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 FOB1YDR110W 1701 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 EAR1YMR171C 1653 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 MKK2YPL140C 1521 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 HNT2YDR305C 654 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 BRE4YDL231C 3378 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 RCM1YNL022C 1473 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 MNT2YGL257C 1677 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 KIN3YAR018C 1308 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 AAD3YCR107W 1092 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 BSC1YDL037C 987 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 RAD14YMR201C 1116 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 RDL1YOR285W 420 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 LRG1YDL240W 3054 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 YEL020CYEL020C 1683 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 YIL171WYIL171W 330 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 KTR2YKR061W 1278 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 YJL206CYJL206C 2277 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 YPL077CYPL077C 723 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 PAH1YMR165C 2589 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 JEN1YKL217W 1851 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1B-ORQ92393 GIP2YER054C 1647 nt6.15□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 ERP2YAL007C 648 nt6.15□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 CRT10YOL063C 2874 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 YOS9YDR057W 1629 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 SOD1YJR104C 465 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 IMA1YGR287C 1770 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 YGR017WYGR017W 894 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 PAL1YDR348C 1500 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 snR7-SsnR7-S 179 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 APA2YDR530C 978 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 YGL185CYGL185C 1140 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 RPS19AYOL121C 435 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 YKR104WYKR104W 921 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 YSF3YNL138W-A 258 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 YER077CYER077C 2067 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 RPL24AYGL031C 468 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 SUI1YNL244C 327 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 snR17bsnR17b 332 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 PUB1YNL016W 1362 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 PBS2YJL128C 2007 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1B-ORQ92393 RPO31YOR116C 4383 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 TVP38YKR088C 1014 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 YBR225WYBR225W 2703 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 EUG1YDR518W 1554 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 GDA1YEL042W 1557 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 YMR084WYMR084W 789 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 BUB3YOR026W 1026 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 SUA7YPR086W 1038 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 MPS3YJL019W 2049 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 PCL10YGL134W 1302 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 HIS5YIL116W 1158 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 YJL193WYJL193W 1209 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 VPS53YJL029C 2469 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 GUP2YPL189W 1830 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 HSP150YJL159W 1242 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 AAD10YJR155W 867 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 TDA8YAL064C-A 381 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 SSU1YPL092W 1377 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 PFK1YGR240C 2964 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 PIR3YKL163W 978 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 RPL19BYBL027W 570 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 ASC1YMR116C 960 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 SSM4YIL030C 3960 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 DBP9YLR276C 1785 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 LSG1YGL099W 1923 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 KRE6YPR159W 2163 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 BBC1YJL020C 3474 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 MRH4YGL064C 1686 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 THI13YDL244W 1023 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 THI11YJR156C 1023 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 GLO4YOR040W 858 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 OPY1YBR129C 987 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 YGR018CYGR018C 330 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 FHL1YPR104C 2811 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 LHP1YDL051W 828 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1B-ORQ92393 UBA1YKL210W 3075 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 HEM15YOR176W 1182 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 MRP51YPL118W 1035 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 PMA1YGL008C 2757 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 YIR007WYIR007W 2295 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 MTC3YGL226W 372 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 PLP2YOR281C 861 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 MET4YNL103W 2019 nt6□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 HST1YOL068C 1512 nt6□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 ROD1YOR018W 2514 nt6□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 AXL2YIL140W 2472 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 ELO2YCR034W 1044 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 FOL2YGR267C 732 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 YDR250CYDR250C 276 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 YIL077CYIL077C 963 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 MMT1YMR177W 1533 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 MAG1YER142C 891 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 AIR1YIL079C 1083 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 ISA1YLL027W 753 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 GAS3YMR215W 1575 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 YPR022CYPR022C 3402 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 DUG1YFR044C 1446 nt5.96□□□□□ -1.45
TY1B-ORQ92393 YAR030CYAR030C 342 nt5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 150.5 ms