Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUMF1Q8NBK3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms