Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN19Q8N6F1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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