Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00518Q8N0U6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00518Q8N0U6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00518Q8N0U6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00518Q8N0U6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00518Q8N0U6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00518Q8N0U6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00518Q8N0U6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00518Q8N0U6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00518Q8N0U6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00518Q8N0U6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00518Q8N0U6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00518Q8N0U6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00518Q8N0U6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00518Q8N0U6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms