Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHST3Q7LGC8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHST3Q7LGC8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms