Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KIAA1549LQ6ZVL6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms