Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWU4

C6orf89, Bombesin receptor-activated protein C6orf89, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf89Q6UWU4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf89Q6UWU4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf89Q6UWU4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf89Q6UWU4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf89Q6UWU4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf89Q6UWU4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf89Q6UWU4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf89Q6UWU4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf89Q6UWU4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf89Q6UWU4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf89Q6UWU4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6orf89Q6UWU4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6orf89Q6UWU4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6orf89Q6UWU4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf89Q6UWU4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf89Q6UWU4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms