Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ANKRD54Q6NXT1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD54Q6NXT1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms