Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LHX8Q68G74 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX8Q68G74 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX8Q68G74 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms