Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf53Q5VUE5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C1orf53Q5VUE5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf53Q5VUE5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms