Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXA9

SIRPB2, Signal-regulatory protein beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPB2Q5JXA9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIRPB2Q5JXA9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRPB2Q5JXA9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRPB2Q5JXA9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRPB2Q5JXA9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRPB2Q5JXA9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRPB2Q5JXA9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRPB2Q5JXA9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRPB2Q5JXA9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRPB2Q5JXA9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRPB2Q5JXA9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRPB2Q5JXA9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRPB2Q5JXA9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRPB2Q5JXA9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRPB2Q5JXA9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRPB2Q5JXA9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRPB2Q5JXA9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms