Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP221Q4G0U5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms