Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NFIXQ14938 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFIXQ14938 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFIXQ14938 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
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