Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAPQ14761 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAPQ14761 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRCAPQ14761 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCAPQ14761 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCAPQ14761 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCAPQ14761 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCAPQ14761 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCAPQ14761 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCAPQ14761 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRCAPQ14761 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCAPQ14761 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRCAPQ14761 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRCAPQ14761 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRCAPQ14761 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRCAPQ14761 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRCAPQ14761 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRCAPQ14761 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRCAPQ14761 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRCAPQ14761 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCAPQ14761 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCAPQ14761 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCAPQ14761 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCAPQ14761 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
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