Protein–RNA interactions for Protein: Q14739

LBR, Lamin-B receptor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBRQ14739 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBRQ14739 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LBRQ14739 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBRQ14739 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBRQ14739 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBRQ14739 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBRQ14739 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBRQ14739 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LBRQ14739 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBRQ14739 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBRQ14739 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBRQ14739 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBRQ14739 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBRQ14739 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LBRQ14739 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBRQ14739 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBRQ14739 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBRQ14739 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBRQ14739 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBRQ14739 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBRQ14739 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBRQ14739 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LBRQ14739 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBRQ14739 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBRQ14739 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBRQ14739 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBRQ14739 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBRQ14739 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBRQ14739 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBRQ14739 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBRQ14739 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBRQ14739 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBRQ14739 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LBRQ14739 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBRQ14739 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBRQ14739 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBRQ14739 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBRQ14739 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBRQ14739 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBRQ14739 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBRQ14739 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBRQ14739 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBRQ14739 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBRQ14739 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBRQ14739 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LBRQ14739 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBRQ14739 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBRQ14739 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBRQ14739 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBRQ14739 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LBRQ14739 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBRQ14739 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBRQ14739 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBRQ14739 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBRQ14739 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBRQ14739 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LBRQ14739 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBRQ14739 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBRQ14739 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBRQ14739 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBRQ14739 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBRQ14739 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LBRQ14739 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBRQ14739 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBRQ14739 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LBRQ14739 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBRQ14739 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBRQ14739 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBRQ14739 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBRQ14739 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LBRQ14739 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LBRQ14739 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LBRQ14739 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LBRQ14739 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LBRQ14739 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBRQ14739 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBRQ14739 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LBRQ14739 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LBRQ14739 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LBRQ14739 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LBRQ14739 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LBRQ14739 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LBRQ14739 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LBRQ14739 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LBRQ14739 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LBRQ14739 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBRQ14739 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBRQ14739 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBRQ14739 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBRQ14739 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBRQ14739 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBRQ14739 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBRQ14739 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBRQ14739 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBRQ14739 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LBRQ14739 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LBRQ14739 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LBRQ14739 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LBRQ14739 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LBRQ14739 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms