Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA1SQ13698 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA1SQ13698 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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