Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLN3Q13286 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLN3Q13286 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLN3Q13286 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLN3Q13286 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLN3Q13286 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLN3Q13286 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLN3Q13286 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLN3Q13286 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLN3Q13286 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLN3Q13286 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLN3Q13286 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLN3Q13286 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLN3Q13286 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLN3Q13286 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLN3Q13286 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLN3Q13286 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLN3Q13286 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLN3Q13286 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLN3Q13286 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLN3Q13286 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLN3Q13286 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CLN3Q13286 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms