Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PRDM2Q13029 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
PRDM2Q13029 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
PRDM2Q13029 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PRDM2Q13029 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
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