Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXC1Q12948 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXC1Q12948 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXC1Q12948 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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