Protein–RNA interactions for Protein: Q12439

TY2A-OR1, Transposon Ty2-OR1 Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2A-OR1Q12439 BUD8YLR353W 1812 nt4.88□□□□□ -1.63
TY2A-OR1Q12439 ADE13YLR359W 1449 nt4.88□□□□□ -1.63
TY2A-OR1Q12439 DUR1,2YBR208C 5508 nt4.88□□□□□ -1.63
TY2A-OR1Q12439 APJ1YNL077W 1587 nt4.87□□□□□ -1.63
TY2A-OR1Q12439 YMR1YJR110W 2067 nt4.87□□□□□ -1.63
TY2A-OR1Q12439 NUP42YDR192C 1293 nt4.87□□□□□ -1.63
TY2A-OR1Q12439 NAG1YGR031C-A 492 nt4.87□□□□□ -1.63
TY2A-OR1Q12439 TFA2YKR062W 987 nt4.87□□□□□ -1.63
TY2A-OR1Q12439 PCL1YNL289W 840 nt4.87□□□□□ -1.63
TY2A-OR1Q12439 YCL041CYCL041C 495 nt4.87□□□□□ -1.63
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TY2A-OR1Q12439 SEC65YML105C 822 nt4.8□□□□□ -1.64
TY2A-OR1Q12439 CMR3YPR013C 954 nt4.8□□□□□ -1.64
TY2A-OR1Q12439 KRS1YDR037W 1776 nt4.8□□□□□ -1.64
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TY2A-OR1Q12439 FUI1YBL042C 1920 nt4.8□□□□□ -1.64
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TY2A-OR1Q12439 PRS1YKL181W 1284 nt4.79□□□□□ -1.64
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