Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 WTM1YOR230W 1314 nt4.64□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 YDL109CYDL109C 1944 nt4.64□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 KAP114YGL241W 3015 nt4.64□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 HXT7YDR342C 1713 nt4.63□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 HXT6YDR343C 1713 nt4.63□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.63□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 HSP31YDR533C 714 nt4.63□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 YGR016WYGR016W 573 nt4.63□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 YLF2YHL014C 1218 nt4.63□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 YMR082CYMR082C 357 nt4.63□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 SBE2YDR351W 2595 nt4.63□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 MSE1YOL033W 1611 nt4.63□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 IXR1YKL032C 1794 nt4.63□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 MDR1YGR100W 2853 nt4.62□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 MAD2YJL030W 591 nt4.62□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 CPR6YLR216C 1116 nt4.62□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 YIM1YMR152W 1098 nt4.62□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 OMS1YDR316W 1416 nt4.62□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 NUP116YMR047C 3342 nt4.62□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 MOT2YER068W 1764 nt4.61□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 HIS4YCL030C 2400 nt4.61□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 MPH2YDL247W 1830 nt4.61□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 MEF2YJL102W 2460 nt4.61□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 SAC1YKL212W 1872 nt4.61□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt4.61□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 MNN11YJL183W 1269 nt4.61□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 CUS2YNL286W 858 nt4.61□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 RPN5YDL147W 1338 nt4.61□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 MAG2YLR427W 2013 nt4.61□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 TIP20YGL145W 2106 nt4.61□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 LYS2YBR115C 4179 nt4.61□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 YDL012CYDL012C 324 nt4.6□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 ARG82YDR173C 1068 nt4.6□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 HNT2YDR305C 654 nt4.6□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 SNA2YDR525W-A 240 nt4.6□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.6□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 YGR066CYGR066C 879 nt4.6□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 NVJ1YHR195W 966 nt4.6□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 YOL035CYOL035C 303 nt4.6□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 ORC6YHR118C 1308 nt4.6□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 CBF5YLR175W 1452 nt4.6□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 DAM1YGR113W 1032 nt4.59□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 FMP33YJL161W 543 nt4.59□□□□□ -1.67
LDB17Q12342 SEO1YAL067C 1782 nt4.58□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 NOP58YOR310C 1536 nt4.58□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YDL124WYDL124W 939 nt4.58□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 SPR28YDR218C 1272 nt4.58□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 TFB3YDR460W 966 nt4.58□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 FMP48YGR052W 1110 nt4.58□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YGR291CYGR291C 222 nt4.58□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 TGS1YPL157W 948 nt4.58□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt4.58□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 IKS1YJL057C 2004 nt4.58□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 GAD1YMR250W 1758 nt4.58□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 NMD3YHR170W 1557 nt4.57□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YGR011WYGR011W 327 nt4.57□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 CIA2YHR122W 696 nt4.57□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YPL113CYPL113C 1191 nt4.57□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 SAP4YGL229C 2457 nt4.57□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 ALG6YOR002W 1635 nt4.57□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YND1YER005W 1893 nt4.56□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YDR445CYDR445C 408 nt4.56□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 SNM1YDR478W 597 nt4.56□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 RPL34AYER056C-A 366 nt4.56□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 COA3YJL062W-A 258 nt4.56□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 LSO1YJR005C-A 282 nt4.56□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 ARC40YBR234C 1155 nt4.56□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 SIR2YDL042C 1689 nt4.56□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 ZPR1YGR211W 1461 nt4.56□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 RIP1YEL024W 648 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YFL068WYFL068W 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 CCS1YMR038C 750 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YPL114WYPL114W 420 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 SRB6YBR253W 366 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 LAS21YJL062W 2493 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 AKL1YBR059C 3327 nt4.55□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YGR266WYGR266W 2106 nt4.54□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 HSP82YPL240C 2130 nt4.54□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 OAF1YAL051W 3144 nt4.54□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 YHL049CYHL049C 816 nt4.54□□□□□ -1.68
LDB17Q12342 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.3 ms