Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 GTT1YIR038C 705 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 PDR15YDR406W 4590 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 FOB1YDR110W 1701 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 EAR1YMR171C 1653 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 MKK2YPL140C 1521 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 HNT2YDR305C 654 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 BRE4YDL231C 3378 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 RCM1YNL022C 1473 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 MNT2YGL257C 1677 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 KIN3YAR018C 1308 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 AAD3YCR107W 1092 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 BSC1YDL037C 987 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 RAD14YMR201C 1116 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 RDL1YOR285W 420 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 LRG1YDL240W 3054 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 YEL020CYEL020C 1683 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 YIL171WYIL171W 330 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 KTR2YKR061W 1278 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 YJL206CYJL206C 2277 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 YPL077CYPL077C 723 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 PAH1YMR165C 2589 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 JEN1YKL217W 1851 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1B-GR3Q12316 GIP2YER054C 1647 nt6.15□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 ERP2YAL007C 648 nt6.15□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 CRT10YOL063C 2874 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 YOS9YDR057W 1629 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 SOD1YJR104C 465 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 IMA1YGR287C 1770 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 YGR017WYGR017W 894 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 PAL1YDR348C 1500 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 snR7-SsnR7-S 179 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 APA2YDR530C 978 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 YGL185CYGL185C 1140 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 RPS19AYOL121C 435 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 YKR104WYKR104W 921 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 YSF3YNL138W-A 258 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 YER077CYER077C 2067 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 RPL24AYGL031C 468 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 SUI1YNL244C 327 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 snR17bsnR17b 332 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 PUB1YNL016W 1362 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 PBS2YJL128C 2007 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1B-GR3Q12316 RPO31YOR116C 4383 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 TVP38YKR088C 1014 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 YBR225WYBR225W 2703 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 EUG1YDR518W 1554 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 GDA1YEL042W 1557 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 YMR084WYMR084W 789 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 BUB3YOR026W 1026 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 SUA7YPR086W 1038 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 MPS3YJL019W 2049 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 PCL10YGL134W 1302 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 HIS5YIL116W 1158 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 YJL193WYJL193W 1209 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 VPS53YJL029C 2469 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 GUP2YPL189W 1830 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 HSP150YJL159W 1242 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 AAD10YJR155W 867 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 TDA8YAL064C-A 381 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 SSU1YPL092W 1377 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 PFK1YGR240C 2964 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 PIR3YKL163W 978 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 RPL19BYBL027W 570 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 ASC1YMR116C 960 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 SSM4YIL030C 3960 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 DBP9YLR276C 1785 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 LSG1YGL099W 1923 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 KRE6YPR159W 2163 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 BBC1YJL020C 3474 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 MRH4YGL064C 1686 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 THI13YDL244W 1023 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 THI11YJR156C 1023 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 GLO4YOR040W 858 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 OPY1YBR129C 987 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 YGR018CYGR018C 330 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 FHL1YPR104C 2811 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 LHP1YDL051W 828 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1B-GR3Q12316 UBA1YKL210W 3075 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 HEM15YOR176W 1182 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 MRP51YPL118W 1035 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 PMA1YGL008C 2757 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 YIR007WYIR007W 2295 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 MTC3YGL226W 372 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 PLP2YOR281C 861 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 MET4YNL103W 2019 nt6□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 HST1YOL068C 1512 nt6□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 ROD1YOR018W 2514 nt6□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 AXL2YIL140W 2472 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 ELO2YCR034W 1044 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 FOL2YGR267C 732 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 YDR250CYDR250C 276 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 YIL077CYIL077C 963 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 MMT1YMR177W 1533 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 MAG1YER142C 891 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 AIR1YIL079C 1083 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 ISA1YLL027W 753 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 GAS3YMR215W 1575 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 YPR022CYPR022C 3402 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 DUG1YFR044C 1446 nt5.96□□□□□ -1.45
TY1B-GR3Q12316 YAR030CYAR030C 342 nt5.96□□□□□ -1.46
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