Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 BUD16YEL029C 939 nt5.63□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 SCS2YER120W 735 nt5.63□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 FAU1YER183C 636 nt5.63□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 ERV14YGL054C 417 nt5.63□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 YKL169CYKL169C 384 nt5.63□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 YOL107WYOL107W 1029 nt5.63□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 RPL3YOR063W 1164 nt5.63□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 NGR1YBR212W 2019 nt5.63□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 YDR336WYDR336W 945 nt5.62□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 YBR016WYBR016W 387 nt5.62□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 TFB6YOR352W 1032 nt5.62□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 ABD1YBR236C 1311 nt5.62□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 PRR1YKL116C 1557 nt5.62□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 PUS1YPL212C 1635 nt5.62□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 YDR249CYDR249C 1122 nt5.61□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 RML2YEL050C 1182 nt5.61□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 MAL13YGR288W 1422 nt5.61□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 SSY5YJL156C 2100 nt5.61□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 SPC34YKR037C 888 nt5.61□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 CTL1YMR180C 963 nt5.61□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 PPG1YNR032W 1107 nt5.61□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 PDI1YCL043C 1569 nt5.61□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 NRD1YNL251C 1728 nt5.6□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 SET4YJL105W 1683 nt5.6□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 NOC4YPR144C 1659 nt5.6□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 STP4YDL048C 1473 nt5.6□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 PCL8YPL219W 1479 nt5.6□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 YDL026WYDL026W 312 nt5.6□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 YDR445CYDR445C 408 nt5.6□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 YNG2YHR090C 849 nt5.6□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 YHR112CYHR112C 1137 nt5.6□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt5.6□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 YNL143CYNL143C 393 nt5.6□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 FEX1YOR390W 1128 nt5.6□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 FEX2YPL279C 1128 nt5.6□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 PRP43YGL120C 2304 nt5.6□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 FPK1YNR047W 2682 nt5.6□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 CTS1YLR286C 1689 nt5.59□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 TIP20YGL145W 2106 nt5.59□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 FAA3YIL009W 2085 nt5.59□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 YER084WYER084W 387 nt5.59□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 SCL1YGL011C 759 nt5.59□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 GRE3YHR104W 984 nt5.59□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 YHR214WYHR214W 612 nt5.59□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 NTR2YKR022C 969 nt5.59□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 YAR066WYAR066W 612 nt5.59□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 PSY3YLR376C 729 nt5.59□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 RIM15YFL033C 5313 nt5.59□□□□□ -1.51
CLF1Q12309 LUC7YDL087C 786 nt5.58□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 YFT2YDR319C 825 nt5.58□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.58□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 YFR035CYFR035C 345 nt5.58□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 ARI1YGL157W 1044 nt5.58□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 YGL262WYGL262W 528 nt5.58□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 CIR1YGR207C 786 nt5.58□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 TRM10YOL093W 882 nt5.58□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 CUE5YOR042W 1236 nt5.58□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 SLM4YBR077C 489 nt5.58□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.58□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 LAS21YJL062W 2493 nt5.58□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 FAP1YNL023C 2898 nt5.58□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 SYG1YIL047C 2709 nt5.58□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 FRE1YLR214W 2061 nt5.57□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 CPS1YJL172W 1731 nt5.57□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 UBP9YER098W 2265 nt5.57□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 RMD1YDL001W 1293 nt5.57□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 PAD1YDR538W 729 nt5.57□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 RMI1YPL024W 726 nt5.57□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 SMA1YPL027W 738 nt5.57□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 YDL183CYDL183C 963 nt5.56□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 PIB1YDR313C 861 nt5.56□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 HAT2YEL056W 1206 nt5.56□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 GLE2YER107C 1098 nt5.56□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 NVJ1YHR195W 966 nt5.56□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 SAW1YAL027W 786 nt5.56□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 TFA2YKR062W 987 nt5.56□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 MER1YNL210W 813 nt5.56□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 RER1YCL001W 567 nt5.56□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 DAK1YML070W 1755 nt5.56□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 FKH1YIL131C 1455 nt5.56□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 SEG2YKL105C 3399 nt5.56□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 LEU1YGL009C 2340 nt5.56□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 YHR177WYHR177W 1362 nt5.55□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 ASA1YPR085C 1332 nt5.55□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 MCH4YOL119C 1506 nt5.55□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 HXT7YDR342C 1713 nt5.55□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 HXT6YDR343C 1713 nt5.55□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 THI5YFL058W 1023 nt5.55□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 YGR122WYGR122W 1209 nt5.55□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 PRS1YKL181W 1284 nt5.55□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 YNL303WYNL303W 348 nt5.55□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 THI12YNL332W 1023 nt5.55□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 ETT1YOR051C 1239 nt5.55□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 UGA2YBR006W 1494 nt5.55□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 DAL81YIR023W 2913 nt5.54□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 RFT1YBL020W 1725 nt5.54□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 ADE3YGR204W 2841 nt5.54□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 ADE6YGR061C 4077 nt5.54□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 NOP16YER002W 696 nt5.54□□□□□ -1.52
CLF1Q12309 YGR168CYGR168C 1131 nt5.54□□□□□ -1.52
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