Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 RCK2YLR248W 1833 nt3.97□□□□□ -1.77
USB1Q12208 YDL109CYDL109C 1944 nt3.97□□□□□ -1.77
USB1Q12208 CAF4YKR036C 1932 nt3.97□□□□□ -1.77
USB1Q12208 EUG1YDR518W 1554 nt3.97□□□□□ -1.77
USB1Q12208 PRP40YKL012W 1752 nt3.97□□□□□ -1.77
USB1Q12208 MCM2YBL023C 2607 nt3.96□□□□□ -1.77
USB1Q12208 CAB1YDR531W 1104 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YER190C-BYER190C-B 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YFL068WYFL068W 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YML133W-BYML133W-B 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 CUS2YNL286W 858 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 THI7YLR237W 1797 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 KEX1YGL203C 2190 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 PMT4YJR143C 2289 nt3.96□□□□□ -1.78
USB1Q12208 CAB3YKL088W 1716 nt3.95□□□□□ -1.78
USB1Q12208 SWC3YAL011W 1878 nt3.95□□□□□ -1.78
USB1Q12208 CBF5YLR175W 1452 nt3.95□□□□□ -1.78
USB1Q12208 SMP1YBR182C 1359 nt3.95□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt3.95□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YHR140WYHR140W 720 nt3.95□□□□□ -1.78
USB1Q12208 ORM2YLR350W 651 nt3.95□□□□□ -1.78
USB1Q12208 RTC5YOR118W 1704 nt3.95□□□□□ -1.78
USB1Q12208 GAS4YOL132W 1416 nt3.95□□□□□ -1.78
USB1Q12208 TFC7YOR110W 1308 nt3.95□□□□□ -1.78
USB1Q12208 THI20YOL055C 1656 nt3.94□□□□□ -1.78
USB1Q12208 IBA57YJR122W 1494 nt3.94□□□□□ -1.78
USB1Q12208 STR2YJR130C 1920 nt3.94□□□□□ -1.78
USB1Q12208 SNF2YOR290C 5112 nt3.94□□□□□ -1.78
USB1Q12208 ARP10YDR106W 855 nt3.94□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YGR066CYGR066C 879 nt3.94□□□□□ -1.78
USB1Q12208 OSW5YMR148W 447 nt3.94□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YNL134CYNL134C 1131 nt3.94□□□□□ -1.78
USB1Q12208 RFA2YNL312W 822 nt3.94□□□□□ -1.78
USB1Q12208 MRM1YOR201C 1239 nt3.94□□□□□ -1.78
USB1Q12208 PZF1YPR186C 1290 nt3.94□□□□□ -1.78
USB1Q12208 AKL1YBR059C 3327 nt3.94□□□□□ -1.78
USB1Q12208 SEO1YAL067C 1782 nt3.94□□□□□ -1.78
USB1Q12208 LAS21YJL062W 2493 nt3.94□□□□□ -1.78
USB1Q12208 LPL1YOR059C 1353 nt3.93□□□□□ -1.78
USB1Q12208 SPR28YDR218C 1272 nt3.93□□□□□ -1.78
USB1Q12208 SNA2YDR525W-A 240 nt3.93□□□□□ -1.78
USB1Q12208 RMR1YGL250W 726 nt3.93□□□□□ -1.78
USB1Q12208 SRB5YGR104C 924 nt3.93□□□□□ -1.78
USB1Q12208 SWP1YMR149W 861 nt3.93□□□□□ -1.78
USB1Q12208 SAP30YMR263W 606 nt3.93□□□□□ -1.78
USB1Q12208 MGR2YPL098C 342 nt3.93□□□□□ -1.78
USB1Q12208 MAG2YLR427W 2013 nt3.93□□□□□ -1.78
USB1Q12208 RTC1YOL138C 4026 nt3.93□□□□□ -1.78
USB1Q12208 OMS1YDR316W 1416 nt3.93□□□□□ -1.78
USB1Q12208 ATM1YMR301C 2073 nt3.93□□□□□ -1.78
USB1Q12208 AIM10YER087W 1731 nt3.92□□□□□ -1.78
USB1Q12208 PGM2YMR105C 1710 nt3.92□□□□□ -1.78
USB1Q12208 CDC10YCR002C 969 nt3.92□□□□□ -1.78
USB1Q12208 ARG82YDR173C 1068 nt3.92□□□□□ -1.78
USB1Q12208 GAT3YLR013W 426 nt3.92□□□□□ -1.78
USB1Q12208 RFU1YLR073C 603 nt3.92□□□□□ -1.78
USB1Q12208 NOP13YNL175C 1212 nt3.92□□□□□ -1.78
USB1Q12208 MDM12YOL009C 816 nt3.92□□□□□ -1.78
USB1Q12208 TIP20YGL145W 2106 nt3.92□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YER158CYER158C 1722 nt3.92□□□□□ -1.78
USB1Q12208 PUT2YHR037W 1728 nt3.92□□□□□ -1.78
USB1Q12208 TYW1YPL207W 2433 nt3.91□□□□□ -1.78
USB1Q12208 ARF2YDL137W 546 nt3.91□□□□□ -1.78
USB1Q12208 RNA15YGL044C 891 nt3.91□□□□□ -1.78
USB1Q12208 GPP1YIL053W 753 nt3.91□□□□□ -1.78
USB1Q12208 COA3YJL062W-A 258 nt3.91□□□□□ -1.78
USB1Q12208 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt3.91□□□□□ -1.78
USB1Q12208 DCS2YOR173W 1062 nt3.91□□□□□ -1.78
USB1Q12208 NCE102YPR149W 522 nt3.91□□□□□ -1.78
USB1Q12208 ATG14YBR128C 1035 nt3.91□□□□□ -1.78
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