Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLEQ07864 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLEQ07864 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLEQ07864 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLEQ07864 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLEQ07864 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLEQ07864 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLEQ07864 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLEQ07864 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLEQ07864 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLEQ07864 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLEQ07864 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLEQ07864 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLEQ07864 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLEQ07864 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLEQ07864 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLEQ07864 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLEQ07864 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLEQ07864 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLEQ07864 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLEQ07864 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLEQ07864 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLEQ07864 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLEQ07864 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLEQ07864 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLEQ07864 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLEQ07864 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLEQ07864 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLEQ07864 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLEQ07864 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLEQ07864 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLEQ07864 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLEQ07864 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLEQ07864 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLEQ07864 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLEQ07864 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLEQ07864 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLEQ07864 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLEQ07864 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLEQ07864 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLEQ07864 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLEQ07864 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLEQ07864 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLEQ07864 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLEQ07864 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLEQ07864 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLEQ07864 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLEQ07864 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLEQ07864 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLEQ07864 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLEQ07864 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLEQ07864 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLEQ07864 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLEQ07864 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLEQ07864 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLEQ07864 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLEQ07864 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLEQ07864 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLEQ07864 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLEQ07864 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLEQ07864 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLEQ07864 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLEQ07864 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLEQ07864 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLEQ07864 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLEQ07864 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLEQ07864 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLEQ07864 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLEQ07864 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLEQ07864 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLEQ07864 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLEQ07864 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLEQ07864 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLEQ07864 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLEQ07864 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLEQ07864 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLEQ07864 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLEQ07864 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLEQ07864 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLEQ07864 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLEQ07864 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLEQ07864 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLEQ07864 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLEQ07864 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLEQ07864 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms