Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 COS7YDL248W 1152 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 MEI4YER044C-A 1227 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YGL082WYGL082W 1146 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 SDT1YGL224C 843 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 PCT1YGR202C 1275 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 LEU5YHR002W 1074 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 BUD19YJL188C 309 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 COS5YJR161C 1152 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 MEU1YLR017W 1014 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YHC1YLR298C 696 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 ZIM17YNL310C 525 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 TUM1YOR251C 915 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YPR078CYPR078C 1119 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YPR172WYPR172W 603 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 PRP24YMR268C 1335 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 PRO2YOR323C 1371 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 FCY22YER060W-A 1593 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YJL163CYJL163C 1668 nt6.64□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 LRS4YDR439W 1044 nt6.63□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 TDA10YGR205W 873 nt6.63□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 SNL1YIL016W 480 nt6.63□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 OPI8YKR035C 642 nt6.63□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YLL056CYLL056C 897 nt6.63□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YLR446WYLR446W 1302 nt6.63□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 PET123YOR158W 957 nt6.63□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 ERG10YPL028W 1197 nt6.63□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 ARR3YPR201W 1215 nt6.63□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YHR020WYHR020W 2067 nt6.62□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 NMD5YJR132W 3147 nt6.62□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 GPA1YHR005C 1419 nt6.62□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 PEX3YDR329C 1326 nt6.62□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 HED1YDR014W-A 489 nt6.62□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 GLE2YER107C 1098 nt6.62□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 AIM20YIL158W 615 nt6.62□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 LCB3YJL134W 1230 nt6.62□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 GLG2YJL137C 1143 nt6.62□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 GCN3YKR026C 918 nt6.62□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt6.62□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 MRPL22YNL177C 930 nt6.62□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YBL096CYBL096C 309 nt6.62□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 FIT2YOR382W 462 nt6.62□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 ASN2YGR124W 1719 nt6.62□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YOS9YDR057W 1629 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YFL040WYFL040W 1623 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 SGE1YPR198W 1632 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 CDC19YAL038W 1503 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 AVT2YEL064C 1443 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 RDI1YDL135C 609 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 TAD1YGL243W 1203 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 STE18YJR086W 333 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 RLP24YLR009W 600 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 GTO3YMR251W 1101 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 MRPL19YNL185C 477 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 TOS6YNL300W 309 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YOL046CYOL046C 675 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 MED7YOL135C 669 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YOR105WYOR105W 327 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 SPC29YPL124W 762 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 PPM2YOL141W 2088 nt6.61□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 UTP5YDR398W 1932 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 MIP1YOR330C 3765 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 SIT1YEL065W 1887 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 KNS1YLL019C 2214 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 ERG9YHR190W 1335 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 CTH1YDR151C 978 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 CAD1YDR423C 1230 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YDR445CYDR445C 408 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 HSP12YFL014W 330 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YGL199CYGL199C 471 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 APN1YKL114C 1104 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YKR073CYKR073C 321 nt6.6□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 STT3YGL022W 2157 nt6.59□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 TIM54YJL054W 1437 nt6.59□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 ECM38YLR299W 1983 nt6.59□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 TAL1YLR354C 1008 nt6.59□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 YPR076WYPR076W 375 nt6.59□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 URK1YNR012W 1506 nt6.59□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 DOT1YDR440W 1749 nt6.59□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YDR203WYDR203W 318 nt6.58□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 HIS1YER055C 894 nt6.58□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 SPT15YER148W 723 nt6.58□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 AGX1YFL030W 1158 nt6.58□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YGR114CYGR114C 390 nt6.58□□□□□ -1.36
HDA3Q06623 YGR149WYGR149W 1299 nt6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.2 ms