Protein–RNA interactions for Protein: Q02785

PDR12, ATP-dependent permease PDR12, yeastyeast

Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR12Q02785 PAH1YMR165C 2589 nt5.89□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 KRE6YPR159W 2163 nt5.89□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt5.89□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt5.89□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt5.89□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt5.89□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 TFB3YDR460W 966 nt5.89□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 FMP32YFL046W 624 nt5.89□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 TVP38YKR088C 1014 nt5.89□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 FRE3YOR381W 2136 nt5.88□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 DNF2YDR093W 4839 nt5.88□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 PMT5YDL093W 2232 nt5.88□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 YGL214WYGL214W 486 nt5.88□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 SDS3YIL084C 984 nt5.88□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 YOR1YGR281W 4434 nt5.88□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 LRG1YDL240W 3054 nt5.87□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 CTR1YPR124W 1221 nt5.87□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 YBR225WYBR225W 2703 nt5.87□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 YEL020CYEL020C 1683 nt5.87□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 PPQ1YPL179W 1650 nt5.86□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 SSH1YBR283C 1473 nt5.86□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 BSC1YDL037C 987 nt5.86□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 RDL1YOR285W 420 nt5.86□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 MTH1YDR277C 1302 nt5.86□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 RPL24AYGL031C 468 nt5.85□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 VPS30YPL120W 1674 nt5.85□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 SPC19YDR201W 498 nt5.84□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 KRE9YJL174W 831 nt5.84□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 KTR2YKR061W 1278 nt5.84□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 ODC2YOR222W 924 nt5.84□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 BBC1YJL020C 3474 nt5.84□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 RCM1YNL022C 1473 nt5.84□□□□□ -1.47
PDR12Q02785 YAR030CYAR030C 342 nt5.84□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 FOB1YDR110W 1701 nt5.83□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 GTT1YIR038C 705 nt5.83□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 SUI1YNL244C 327 nt5.83□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 MET4YNL103W 2019 nt5.82□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 COX11YPL132W 903 nt5.82□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 BOP2YLR267W 1713 nt5.82□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 HFD1YMR110C 1599 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 CLA4YNL298W 2529 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 ELO2YCR034W 1044 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 YMR084WYMR084W 789 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 UBA1YKL210W 3075 nt5.81□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 RPO31YOR116C 4383 nt5.8□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 NUP2YLR335W 2163 nt5.8□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 RAD14YMR201C 1116 nt5.79□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 RPS19AYOL121C 435 nt5.79□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 PCS60YBR222C 1632 nt5.79□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 YBR053CYBR053C 1077 nt5.79□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 UBP9YER098W 2265 nt5.78□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 BRE4YDL231C 3378 nt5.78□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 GIP2YER054C 1647 nt5.78□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 YDR230WYDR230W 348 nt5.78□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 GPP1YIL053W 753 nt5.78□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 TRS120YDR407C 3870 nt5.78□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 YLR446WYLR446W 1302 nt5.78□□□□□ -1.48
PDR12Q02785 MRH4YGL064C 1686 nt5.77□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 ARX1YDR101C 1782 nt5.77□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 THI13YDL244W 1023 nt5.77□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 THI11YJR156C 1023 nt5.77□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 MMT1YMR177W 1533 nt5.77□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 IMA1YGR287C 1770 nt5.77□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 AAD3YCR107W 1092 nt5.76□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 MRP21YBL090W 534 nt5.76□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 TFC7YOR110W 1308 nt5.76□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 MST1YKL194C 1389 nt5.76□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 DUG1YFR044C 1446 nt5.76□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 VPS53YJL029C 2469 nt5.76□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 FHL1YPR104C 2811 nt5.76□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 PFK1YGR240C 2964 nt5.75□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 FDC1YDR539W 1512 nt5.75□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 KIN3YAR018C 1308 nt5.75□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 HLJ1YMR161W 675 nt5.75□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 ARG4YHR018C 1392 nt5.74□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 RMR1YGL250W 726 nt5.74□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 CPA1YOR303W 1236 nt5.74□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 ROG3YFR022W 2202 nt5.74□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 RPL22AYLR061W 366 nt5.74□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 HXT17YNR072W 1695 nt5.73□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 YOR296WYOR296W 3870 nt5.73□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 RPA14YDR156W 414 nt5.73□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 NMT1YLR195C 1368 nt5.72□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 PIR3YKL163W 978 nt5.72□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 CST6YIL036W 1764 nt5.72□□□□□ -1.49
PDR12Q02785 LDB19YOR322C 2457 nt5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.9 ms