Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX1P67809 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX1P67809 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX1P67809 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX1P67809 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX1P67809 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX1P67809 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX1P67809 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX1P67809 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX1P67809 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX1P67809 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX1P67809 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX1P67809 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX1P67809 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX1P67809 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX1P67809 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX1P67809 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX1P67809 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX1P67809 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBX1P67809 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX1P67809 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX1P67809 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX1P67809 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX1P67809 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX1P67809 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX1P67809 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX1P67809 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX1P67809 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX1P67809 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX1P67809 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX1P67809 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX1P67809 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBX1P67809 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX1P67809 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX1P67809 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX1P67809 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX1P67809 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX1P67809 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX1P67809 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX1P67809 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX1P67809 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX1P67809 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX1P67809 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX1P67809 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBX1P67809 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX1P67809 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX1P67809 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX1P67809 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX1P67809 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX1P67809 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX1P67809 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX1P67809 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX1P67809 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX1P67809 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX1P67809 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBX1P67809 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
YBX1P67809 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
YBX1P67809 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX1P67809 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX1P67809 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX1P67809 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX1P67809 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX1P67809 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX1P67809 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX1P67809 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX1P67809 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX1P67809 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX1P67809 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX1P67809 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX1P67809 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX1P67809 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX1P67809 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBX1P67809 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
YBX1P67809 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
YBX1P67809 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YBX1P67809 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YBX1P67809 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
YBX1P67809 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YBX1P67809 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
YBX1P67809 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
YBX1P67809 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YBX1P67809 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YBX1P67809 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
YBX1P67809 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YBX1P67809 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms