Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-21P61565 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVK-21P61565 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms