Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms