Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATN1P54259 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATN1P54259 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATN1P54259 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATN1P54259 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATN1P54259 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATN1P54259 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATN1P54259 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATN1P54259 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATN1P54259 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATN1P54259 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATN1P54259 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATN1P54259 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATN1P54259 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATN1P54259 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATN1P54259 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATN1P54259 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATN1P54259 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATN1P54259 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATN1P54259 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATN1P54259 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATN1P54259 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATN1P54259 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATN1P54259 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATN1P54259 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATN1P54259 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATN1P54259 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATN1P54259 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATN1P54259 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATN1P54259 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATN1P54259 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATN1P54259 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATN1P54259 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATN1P54259 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATN1P54259 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATN1P54259 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATN1P54259 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATN1P54259 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATN1P54259 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATN1P54259 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATN1P54259 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATN1P54259 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATN1P54259 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATN1P54259 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATN1P54259 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATN1P54259 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATN1P54259 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATN1P54259 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATN1P54259 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATN1P54259 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATN1P54259 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATN1P54259 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATN1P54259 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATN1P54259 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATN1P54259 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATN1P54259 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATN1P54259 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATN1P54259 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATN1P54259 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATN1P54259 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATN1P54259 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATN1P54259 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATN1P54259 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATN1P54259 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATN1P54259 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATN1P54259 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATN1P54259 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATN1P54259 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATN1P54259 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATN1P54259 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATN1P54259 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATN1P54259 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATN1P54259 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATN1P54259 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATN1P54259 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATN1P54259 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATN1P54259 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATN1P54259 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATN1P54259 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATN1P54259 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATN1P54259 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATN1P54259 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATN1P54259 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATN1P54259 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATN1P54259 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATN1P54259 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATN1P54259 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATN1P54259 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATN1P54259 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATN1P54259 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATN1P54259 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATN1P54259 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATN1P54259 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATN1P54259 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATN1P54259 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATN1P54259 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATN1P54259 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATN1P54259 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATN1P54259 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATN1P54259 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms