Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAMP7P51809 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms