Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MARCKSL1P49006 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCKSL1P49006 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms