Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin1P35438 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin1P35438 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin1P35438 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin1P35438 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin1P35438 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin1P35438 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin1P35438 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms