Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC13P31276 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXC13P31276 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC13P31276 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms