Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCHP24723 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCHP24723 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCHP24723 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCHP24723 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCHP24723 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCHP24723 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCHP24723 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCHP24723 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCHP24723 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCHP24723 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCHP24723 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCHP24723 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKCHP24723 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCHP24723 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms