Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCLP18206 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCLP18206 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCLP18206 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCLP18206 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCLP18206 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCLP18206 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCLP18206 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCLP18206 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCLP18206 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCLP18206 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCLP18206 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCLP18206 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCLP18206 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCLP18206 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCLP18206 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCLP18206 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCLP18206 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCLP18206 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCLP18206 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VCLP18206 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCLP18206 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCLP18206 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCLP18206 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCLP18206 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCLP18206 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCLP18206 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCLP18206 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCLP18206 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCLP18206 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCLP18206 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCLP18206 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCLP18206 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCLP18206 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCLP18206 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VCLP18206 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCLP18206 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCLP18206 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCLP18206 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCLP18206 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCLP18206 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCLP18206 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCLP18206 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCLP18206 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCLP18206 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCLP18206 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCLP18206 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCLP18206 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCLP18206 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCLP18206 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCLP18206 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCLP18206 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCLP18206 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCLP18206 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCLP18206 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCLP18206 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCLP18206 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCLP18206 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCLP18206 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCLP18206 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCLP18206 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCLP18206 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCLP18206 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCLP18206 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCLP18206 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCLP18206 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCLP18206 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCLP18206 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCLP18206 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCLP18206 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCLP18206 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCLP18206 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCLP18206 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCLP18206 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VCLP18206 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCLP18206 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCLP18206 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCLP18206 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCLP18206 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCLP18206 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VCLP18206 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCLP18206 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCLP18206 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCLP18206 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCLP18206 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms