Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYN1P17600 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYN1P17600 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYN1P17600 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYN1P17600 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYN1P17600 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYN1P17600 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYN1P17600 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYN1P17600 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYN1P17600 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYN1P17600 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYN1P17600 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYN1P17600 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYN1P17600 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYN1P17600 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYN1P17600 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYN1P17600 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYN1P17600 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYN1P17600 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYN1P17600 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYN1P17600 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYN1P17600 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYN1P17600 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYN1P17600 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYN1P17600 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYN1P17600 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYN1P17600 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYN1P17600 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYN1P17600 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYN1P17600 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYN1P17600 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYN1P17600 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYN1P17600 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYN1P17600 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYN1P17600 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYN1P17600 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYN1P17600 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYN1P17600 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYN1P17600 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYN1P17600 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYN1P17600 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYN1P17600 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYN1P17600 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYN1P17600 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYN1P17600 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYN1P17600 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYN1P17600 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYN1P17600 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYN1P17600 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYN1P17600 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYN1P17600 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYN1P17600 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYN1P17600 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYN1P17600 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYN1P17600 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYN1P17600 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYN1P17600 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYN1P17600 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYN1P17600 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYN1P17600 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYN1P17600 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYN1P17600 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYN1P17600 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYN1P17600 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYN1P17600 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SYN1P17600 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYN1P17600 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYN1P17600 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYN1P17600 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYN1P17600 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYN1P17600 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYN1P17600 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYN1P17600 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYN1P17600 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYN1P17600 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYN1P17600 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYN1P17600 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYN1P17600 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYN1P17600 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYN1P17600 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYN1P17600 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYN1P17600 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYN1P17600 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYN1P17600 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms