Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARGP13631 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARGP13631 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARGP13631 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARGP13631 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARGP13631 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARGP13631 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARGP13631 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARGP13631 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARGP13631 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RARGP13631 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARGP13631 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARGP13631 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARGP13631 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RARGP13631 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARGP13631 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARGP13631 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARGP13631 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARGP13631 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARGP13631 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARGP13631 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARGP13631 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARGP13631 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARGP13631 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARGP13631 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARGP13631 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RARGP13631 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RARGP13631 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARGP13631 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARGP13631 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARGP13631 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARGP13631 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARGP13631 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARGP13631 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARGP13631 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARGP13631 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RARGP13631 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARGP13631 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARGP13631 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RARGP13631 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARGP13631 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARGP13631 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARGP13631 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARGP13631 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARGP13631 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARGP13631 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARGP13631 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARGP13631 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARGP13631 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARGP13631 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARGP13631 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARGP13631 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARGP13631 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARGP13631 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARGP13631 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RARGP13631 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARGP13631 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARGP13631 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARGP13631 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARGP13631 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARGP13631 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARGP13631 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARGP13631 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RARGP13631 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARGP13631 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARGP13631 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARGP13631 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARGP13631 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARGP13631 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARGP13631 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARGP13631 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARGP13631 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARGP13631 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RARGP13631 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARGP13631 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RARGP13631 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARGP13631 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARGP13631 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARGP13631 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARGP13631 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARGP13631 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARGP13631 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARGP13631 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RARGP13631 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARGP13631 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARGP13631 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARGP13631 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARGP13631 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RARGP13631 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RARGP13631 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARGP13631 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RARGP13631 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARGP13631 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARGP13631 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARGP13631 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RARGP13631 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARGP13631 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARGP13631 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RARGP13631 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARGP13631 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms